Quelles sont les microbiomes?
à l’intérieur comme à l’extérieur, nos corps abritent une vaste gamme de micro-organismes. Bien que les bactéries soient les plus grands acteurs, nous hébergeons également des organismes unicellulaires connus sous le nom d’archées, ainsi que des champignons, des virus et d’autres microbes-y compris les virus qui attaquent les bactéries. Ensemble, ils sont surnommés le microbiote humain., Le microbiome de votre corps est tous les gènes que votre microbiote contient, mais familièrement les deux termes sont souvent utilisés de manière interchangeable.
attendez, ce ne sont pas les microbes censé être dangereux?
c’est un peu un spectre: certains sont des agents pathogènes, mais d’autres ne deviennent nocifs que s’ils se trouvent au mauvais endroit ou augmentent en nombre, et certains sont très utiles pour le corps – par exemple en aidant à décomposer la gamme de sucres présents dans le lait maternel humain., « Ces sucres ne sont pas décomposés par le nourrisson”, a déclaré le professeur John Cryan, neuropharmacologue et expert en microbiome de L’University College Cork. Au lieu de cela, les microbes dans l’intestin du bébé font le travail.
D’autres rôles clés de nos microbes comprennent la programmation du système immunitaire, la fourniture de nutriments pour nos cellules et la prévention de la colonisation par des bactéries et des virus nocifs.
d’où viennent mes microbes intestinaux? Est-ce que je viens les chercher dans mon environnement?
en partie. Mais c’est plus compliqué que cela., « C’est encore un peu controversé, mais pour la plupart, on pense que nous sommes stériles lorsque nous sommes in utero, et que nous naissons, que nous émergeons par le canal de naissance de nos mamans, nous obtenons cette bactérie de transfert”, a déclaré Cryan. « C’est comme une gorgée à la naissance. Ces bactéries sont vraiment importantes pour démarrer tout le processus. »
Cryan note que pendant la grossesse, le microbiome d’une mère se déplace, apparemment vers un mélange optimal pour la progéniture. « Si vous n’êtes pas né par accouchement vaginal, mais que vous êtes né par section, les choses commencent à être différentes”, a-t-il déclaré., En effet, des études ont suggéré que ces différences pourraient être l’une des raisons pour lesquelles les bébés nés par césarienne ont un risque plus élevé de maladies, y compris l’asthme et le diabète de type 1. Cela dit, les médecins ont mis en garde les parents contre toute tentative de semer des bébés nés par césarienne avec des bactéries vaginales.
notre microbiome intestinal change rapidement au cours de notre première année ou deux, façonné par les microbes dans le lait maternel, l’environnement et d’autres facteurs, et se stabilise vers l’âge de trois ans., Mais notre environnement, notre alimentation à long terme, le stress et les médicaments que nous prenons, tels que les antibiotiques, continuent de jouer un rôle à mesure que nous vieillissons, ce qui signifie que notre microbiome peut changer tout au long de notre vie.
Il semble que les microbes soient partout – de combien parlons-nous?
le chiffre qui a été banni depuis les années 1970 est que les microbes sont plus nombreux que nos propres cellules d’environ 10 à un. Mais une étude de 2016 suggère qu’en fait les cellules microbiennes et les cellules humaines coexistent quelque part autour d’un 1.,3 pour un ratio-suggérant qu’ils ne sont que légèrement plus nombreux que nos propres cellules, bien que cela ne compte pas les virus et les particules virales.
cela signifie-t-il que je ne suis pas humain?
certains disent que nous devrions être considérés comme un holobionte, un terme qui reflète la relation intime et co-dépendante entre les humains et les microbes. « Je dis à cette blague que la prochaine fois que quelqu’un va aux toilettes et qu’il se débarrasse de certains de ses microbes, il devient plus humain”, a déclaré Cryan.
Mais Ellen Clarke, philosophe de la biologie à L’Université de Leeds, n’est pas convaincue., « Tout dépend de ce que vous entendez par” humain « en premier lieu », a-t-elle déclaré. « Si vous pensez qu’un humain est un ensemble de cellules qui partagent toutes des copies des mêmes chromosomes, alors il est choquant de se faire dire que notre corps contient des cellules avec de l’ADN bactérien. »
Mais comme le souligne Clarke, les cellules humaines ne contiennent pas seulement des chromosomes, mais portent également de l’ADN au sein de nos centrales cellulaires, les mitochondries, qui sont des descendants évolutifs des bactéries., Notre génome contient également des étendues de matériel génétique appelées transposons qui, au moins dans certains cas, auraient été introduits il y a longtemps par des virus. « Je préfère définir un humain en termes évolutifs, et si nous faisons cela, les mitochondries sont des parties d’un humain, tout comme les transposons, mais les microbes intestinaux ne le sont pas, et les membres prothétiques ni les fœtus à naître ne le sont pas”, a déclaré Clarke, soulignant que les microbes peuvent s’échapper du corps et vivre sans nous.
Les microbes sont-ils les mêmes dans mon intestin que sur ma peau?,
non, les différentes parties du corps – la peau, le vagin, l’intestin – ont toutes des communautés de microbes très différentes et distinctes. Alors que les microbes intestinaux ont attiré beaucoup d’attention, les microbes ailleurs sont également importants: dans des études récentes, Les scientifiques ont constaté que les bactéries couramment présentes sur la peau pourraient aider à protéger contre le cancer de la peau.
les Microbiomes diffèrent également d’une personne à l’autre., ” Lorsque vous regardez les microbiomes actifs globaux entre deux personnes en bonne santé, même si elles vivent dans la même ville, vous voyez une énorme quantité de désaccord dans leur microbiome », a déclaré Rob Knight, professeur de pédiatrie, d’informatique et d’ingénierie à L’Université de Californie à San Diego et expert du microbiome humain.
la variabilité du microbiome intestinal, Note Knight, aide à expliquer pourquoi les gens réagissent différemment aux mêmes aliments., « Que les tomates soient bonnes ou mauvaises pour vous, que le riz soit bon pour vous ou pire pour vous que la crème glacée, etc., s’explique par votre microbiome”, a-t-il déclaré.
pourquoi le microbiome est-il devenu un sujet si brûlant pour la recherche?
Au cours des dernières années, le microbiome intestinal en particulier a été lié à une pléthore de maladies et de conditions, du diabète à l’autisme et à l’anxiété à l’obésité.,
Le microbiome intestinal a également été lié à la façon dont les individus réagissent à certains médicaments, y compris la façon dont les patients atteints de cancer réagissent à la chimiothérapie, et il a même été suggéré, provisoirement, qu’il pourrait être lié à la façon dont nous dormons.
pendant ce temps, une série d’études ont soulevé l’importance d’autres aspects de notre microbiome, y compris que le microbiome vaginal est important pour déterminer si un médicament de prévention du VIH appliqué au vagin est efficace.
Pourquoi pensons-nous que le microbiome est liée à toutes ces conditions?,
bien que certains liens soient issus de la comparaison des microbiomes de différents groupes de personnes, tels que ceux atteints d’une maladie particulière par rapport aux individus en bonne santé, un grand acteur de la recherche sur le microbiome est la souris sans germes.
Cet organisme est élevé dans un environnement stérile et peut ensuite être exposé à des microbes particuliers, ou à des groupes de microbes, pour explorer leur impact. De telles études ont été essentielles pour établir des liens possibles entre le microbiome intestinal et de nombreux aspects de notre santé, y compris l’humeur et l’obésité.,
est-ce que certains microbes sont importants, ou s’agit-il de la communauté microbienne dans son ensemble?
C’est l’épineuse question. Dans certaines expériences, des souches particulières de bactéries ont été liées à des effets ou des conditions particuliers, tandis que d’autres ont montré que la diversité du microbiome, ou l’abondance relative des espèces, est importante.,
« c’est un peu comme une forêt tropicale: vous pourriez avoir une très belle fougère qui est très heureuse, mais si c’est la seule chose dans votre forêt tropicale et que vous n’avez pas de diversité, ce ne sera pas un bon sol”, a déclaré Tim Spector, professeur d’épidémiologie génétique au King’s College de Londres et auteur de The Diet Myth. En ce qui concerne le microbiome, « il s’agit d’avoir la bonne communauté de bactéries qui travaillent ensemble et produisent ensemble les bons produits chimiques pour votre corps.,”
Alors peut-être les microbes affecter notre poids, ou même de notre cerveau? Ça a l’air un peu de science-fiction.
en ce qui concerne l’obésité, il existe plusieurs façons dont les microbes intestinaux peuvent influencer les choses, notamment par l’appétit, la production de gaz, l’efficacité de l’utilisation des aliments et l’impact sur le système immunitaire et l’inflammation.
Quand il s’agit d’affecter l’humeur, il y a également plusieurs mécanismes., L’un est via le nerf vague, une autoroute à double sens qui va de notre cerveau à divers organes du corps, y compris l’intestin.
avec le microbiome lié à tant de conditions, le bricoler promet-il toute une gamme de nouveaux traitements?
Il convient d’être prudent: de nombreuses études montrent des associations plutôt que de cause à effet, et certaines sont basées uniquement sur des études chez des souris sans germes et n’ont pas été explorées chez l’homme. Même chez la souris, les choses ne sont pas simples – les effets ne sont pas toujours les mêmes pour les deux sexes et peuvent différer pour différentes souches de souris.,
et il y a d’autres facteurs à prendre en compte: « pour l’obésité à quoi elle ressemble dans différentes populations humaines, différents types de microbes sont impliqués dans les différences entre les humains maigres et obèses”, a déclaré Knight.
Spector a déclaré: « Je pense que tout le monde a raison d’être sceptique, et beaucoup de liens peuvent simplement être qui ne sont pas nécessairement la cause de , mais ils pourraient être un effet secondaire de celui-ci.”
d’Autres disent qu’il n’est pas surprenant que notre microbiome peut être étroitement lié à notre santé., ” Tout le développement humain et tous les systèmes du corps ont tous évolué, ou co-évolué, avec nos microbes », a déclaré Cryan. « En tant qu’humains, nous sommes très centrés sur l’humain et nous pensons que les cellules et les gènes humains ont la primauté, mais les microbes étaient là en premier.”
cela affecte-t-il réellement les patients?
Jusqu’à un certain point. Le domaine a déjà permis des avancées dans le traitement du C difficile – une infection qui provoque de graves diarrhées et peut s’avérer mortelle., Les Patients peuvent maintenant recevoir des transplantations fécales d’un donneur ayant un microbiome sain pour « réinitialiser” leur communauté interne – une procédure qui a été démontrée pour guérir rapidement la maladie.
certains chercheurs, dont Cryan, croient que la recherche sur le microbiome pourrait mener au développement de nouvelles thérapies en santé mentale. « Nous avons inventé le terme « psychobiotique » une intervention ciblée du microbiome pour la santé du cerveau », a-t-il déclaré.
bien que cela puisse être loin, Cryan croit qu’il deviendra routinier pour les médecins de garder un œil sur la composition des microbiomes des patients., « Je pense personnellement que la médecine dérivée des bactéries ou du microbiome est l’avenir de la médecine de précision”, a-t-il déclaré.
passons à la chasse: que puis-je faire pour garder mon microbiome en bonne forme?
c’est là que les prébiotiques et les probiotiques entrent en jeu: les premiers sont des substances, telles que la fibre inuline, sur lesquelles des microbes utiles peuvent prospérer, tandis que les seconds sont des microbes eux-mêmes qui sont considérés comme bénéfiques pour la santé, tels que les espèces Lactobacillus et Bifidobacterium.,
alors que les prébiotiques et les probiotiques peuvent être pris comme suppléments, si vous devez débourser pour eux est une autre question: il y a peu de conseils sur les prébiotiques ou les probiotiques que les gens devraient consommer pour une situation particulière, et quand il s’agit de probiotiques, ce n’est pas une certitude morte que les microbes vont coloniser votre intestin quand ils y arrivent, ou s’ils offriront des avantages aux personnes déjà en bonne santé, comme la prévention des maladies. Cela dit, si vous prenez des antibiotiques ou si vous avez le SCI, il existe des preuves que les probiotiques pourraient être une bonne idée.,
« on ne sait pas encore si vous êtes mieux d’avoir juste beaucoup de yaourt et d’autres aliments fermentés ou de prendre ces formulations”, a déclaré Spector, ajoutant qu’en général, il recommande d’opter pour modifier votre alimentation pour obtenir une dose de probiotiques, car il n’est pas clair quelles souches les individus devraient prendre. Il en va de même pour les prébiotiques: « il y a plus de variété dans les aliments en termes de fibres, donc plus de variété dans les microbes”, a-t-il déclaré. « Idéalement, vous combinez un prébiotique et un probiotique: quelque chose comme la choucroute ou le kimchi.”
Quelle est la prochaine étape?,
Les projecteurs sont braqués sur les mécanismes par lesquels les microbes sont liés à la santé humaine. Parmi les énigmes est de savoir comment et pourquoi les différentes souches de bactéries ont des effets différents, tandis que les chercheurs développent également des études pour explorer comment le microbiome influence notre réponse à la nourriture, et comment différents régimes peuvent modifier le microbiome. Il est également nécessaire de prendre plus de résultats passionnants des études sur la souris et de les sonder chez l’homme, de préférence par le biais d’essais témoins randomisés.,
pour en savoir plus:
I Contain Multitudes, par Ed Yong
Gut: L’histoire intérieure de L’organe le plus sous-estimé de notre corps, par Giulia Enders
La Révolution Psychobiotique, par Scott C Anderson avec John Cryan et Ted Dinan
Suivez votre intestin: comment l’écosystème dans votre intestin détermine votre santé, votre humeur, et plus, par Rob Knight
Illustrations: accueil