Microbiologia (Português)

Objetivos

  • Descrever a estrutura bioquímica do deoxyribonucleotides
  • Identificar os pares de base utilizada na síntese de deoxyribonucleotides
  • a Explicar por que a dupla hélice do DNA é descrito como antiparallel

No Metabolismo Microbiano, discutimos três classes de macromoléculas: proteínas, lipídios e carboidratos. Neste capítulo, vamos discutir uma quarta classe de macromoléculas: ácidos nucleicos., Como outras macromoléculas, ácidos nucleicos são compostos de monômeros, chamados nucleotídeos, que são polimerizados para formar grandes cadeias. Cada cadeia de ácido nucleico contém certos nucleótidos que aparecem em uma certa ordem dentro da cadeia, Chamada sua sequência base. A sequência de base do ácido desoxirribonucleico (ADN) é responsável pelo transporte e retenção da informação hereditária numa célula., Em mecanismos de genética microbiana, discutiremos em detalhe as maneiras pelas quais o DNA usa sua própria sequência de base para dirigir sua própria síntese, bem como a síntese de RNA e proteínas, que, por sua vez, dá origem a produtos com estrutura e função diversificadas. Nesta seção, discutiremos a estrutura básica e a função do DNA.

nucleótidos de ADN

os blocos de construção dos ácidos nucleicos são nucleótidos. Nucleótidos que compõem o DNA são chamados desoxirribonucleótidos., Os três componentes de um desoxirribonucleótido são um açúcar de cinco átomos de carbono chamado desoxirribose, um grupo fosfato, e uma base azotada, uma estrutura de anel contendo nitrogênio que é responsável por emparelhamento de base complementar entre as cadeias de ácido nucleico (Figura 1). Os átomos de carbono dos cinco carbono desoxirribose são numerados 1ʹ, 2ʹ, 3ʹ, 4ʹ, e 5ʹ (1ʹ é lido como “um nobre”). Um nucleósido inclui o açúcar de cinco carbonos e a base azotada.

Figura 1., a) cada desoxirribonucleótido é constituído por um açúcar denominado desoxirribose, um grupo fosfato e uma base azotada—neste caso, adenina. b) os cinco carbonos da desoxirribose são designados por 1ʹ, 2ʹ, 3ʹ, 4ʹ e 5..

o desoxirribonucleótido é nomeado de acordo com as bases azotadas (Figura 2). As bases azotadas adenina (A) e guanina (G) são as purinas; elas têm uma estrutura de dois anéis com um anel de seis carbonos fundido a um anel de cinco carbonos. As pirimidinas, citosina (C) e timina (T), são bases azotadas menores que têm apenas uma estrutura de anel de seis átomos de carbono.,

Figura 2. Bases azotadas dentro do DNA são categorizadas em duas anéis de purinas adenina e guanina e as pirimidinas de anel único citosina e timina. A timina é única para o ADN.

Individual análogos de triphosphates combinam-se entre si por ligações covalentes conhecido como 5ʹ-3ʹ phosphodiester laços ou ligações através do qual o grupo fosfato ligado ao 5ʹ de carbono do que o açúcar de um nucleotídeo títulos para o grupo hidroxila do 3ʹ de carbono do açúcar do próximo nucleotídeo., A ligação fosfodiéster entre os nucleótidos forma a espinha dorsal de açúcar-fosfato, a estrutura alternada de açúcar-fosfato que compõe a estrutura de uma cadeia de ácidos nucleicos (Figura 3). Durante o processo de polimerização, são utilizados trifosfatos de desoxinucleótido (dNTP). Para construir a espinha dorsal de fosfato de açúcar, os dois fosfatos terminais são liberados do dNTP como um pirofosfato. The resulting strand of nucleic acid has a free phosphate group at the 5ʹ carbon end and a free hydroxyl group at the 3ʹ carbon end., Os dois grupos não utilizados de fosfato do trifosfato nucleotídeo são liberados como pirofosfato durante a formação de ligação fosfodiéster. O pirofosfato é subsequentemente hidrolisado, liberando a energia usada para impulsionar a polimerização de nucleótidos.

Figura 3. Ligações fosfodiésteres formam-se entre o grupo fosfato ligado ao carbono 5ʹ de um nucleótido e o grupo hidroxilo do carbono 3ʹ no próximo nucleótido, trazendo polimerização de nucleótidos em cadeias de ácido nucleico. Note as extremidades 5ʹ e 3ʹ desta cadeia de ácidos nucleicos.,

pense sobre isso

  • O que significa as extremidades 5ʹ e 3ʹ de uma cadeia de ácido nucleico?descobrindo a dupla hélice

    no início da década de 1950, evidências consideráveis haviam se acumulado indicando que o DNA era o material genético das células, e agora a corrida estava para descobrir sua estrutura tridimensional., Em torno deste tempo, bioquímico Austríaco Erwin Chargaff (1905-2002) analisou o conteúdo de DNA em espécies diferentes e descobriu que a adenina, timina, guanina e citosina não foram encontrados em quantidades iguais, e que é variado de espécie para espécie, mas não entre indivíduos da mesma espécie. Ele descobriu que a quantidade de adenina era muito perto de igualar a quantidade de timina, e a quantidade de citosina estava muito perto de igualar a quantidade de guanina, ou A = T e G = C. Estas relações são também conhecidas como regras de Chargaff.,

    Figura 4. O padrão de difração de raios-X do ADN mostra a sua natureza helicoidal. (credit: National Institutes of Health)

    outros cientistas também exploraram ativamente este campo durante meados do século XX. Em 1952, o cientista americano Linus Pauling (1901-1994) foi o principal químico estrutural e favorito do mundo para resolver a estrutura do DNA., Pauling havia descoberto anteriormente a estrutura das hélices de proteína α, usando difração de raios X, e, baseado em imagens de difração de raios X de DNA feitas em seu laboratório, ele propôs um modelo de DNA de cadeia tripla. Ao mesmo tempo, pesquisadores britânicos Rosalind Franklin (1920-1958) e seu estudante de graduação R. G. Gosling também estavam usando difração de raios X para entender a estrutura do DNA (Figura 4). Foi a experiência científica de Franklin que resultou na produção de imagens de difração de raios-X mais bem definidas do DNA que iria claramente mostrar a estrutura geral de dupla hélice do DNA.,James Watson (1928–), um cientista americano, e Francis Crick (1916-2004), um cientista britânico, estavam trabalhando juntos na década de 1950 para descobrir a estrutura do DNA. Eles usaram as regras de Chargaff e as imagens de difração de raios-X de Franklin e Wilkins de fibras de DNA para montar a combinação purina-pirimidina da molécula de DNA duplo helicoidal (Figura 5). Em abril de 1953, Watson e Crick publicaram seu modelo de dupla hélice de DNA na natureza. A mesma edição também incluiu artigos de Wilkins e colegas, cada um descrevendo diferentes aspectos da estrutura molecular do DNA., Em 1962, James Watson, Francis Crick e Maurice Wilkins foram agraciados com o Nobel de Fisiologia e medicina. Infelizmente, até então Franklin tinha morrido, e os prêmios Nobel na época não foram concedidos postumamente. No entanto, prosseguiram os trabalhos sobre a aprendizagem da estrutura do ADN. Em 1973, Alexander Rich (1924-2015) e colegas foram capazes de analisar cristais de DNA para confirmar e elucidar ainda mais a estrutura do DNA.

    Figura 5., Em 1953, James Watson e Francis Crick construíram este modelo da estrutura do DNA, mostrado aqui em exposição no Science Museum em Londres.Qual é o mérito dos cientistas por descreverem a estrutura molecular do ADN?

    estrutura do ADN

    Watson e Crick propuseram que o ADN é constituído por duas cadeias que são torcidas uma à outra para formar uma hélice destraada. As duas cadeias de ADN são antiparalelas, de tal forma que a extremidade 3ʹ de uma cadeia enfrenta a extremidade 5ʹ da outra (figura 6)., A extremidade 3ʹ de cada cadeia tem um grupo hidroxilo livre, enquanto a extremidade 5ʹ de cada cadeia tem um grupo fosfato livre. O açúcar e o fosfato dos nucleótidos polimerizados formam a espinha dorsal da estrutura, enquanto as bases azotadas são empilhadas no interior. Estas bases azotadas no interior da molécula interagem entre si, emparelhamento base.

    a análise dos padrões de difração do ADN determinou que existem aproximadamente 10 bases por volta do ADN., O espaçamento assimétrico das espinhas dorsais de fosfato de açúcar gera grandes ranhuras (onde a espinha dorsal está muito distante) e pequenas ranhuras (onde a espinha dorsal está próxima) (figura 6). Estas ranhuras são locais onde as proteínas se podem ligar ao ADN. A ligação destas proteínas pode alterar a estrutura do ADN, regular a replicação ou regular a transcrição do ADN em ARN.

    Figura 6. Watson e Crick propuseram o modelo Double helix para o DNA., a) as espinhas dorsais de fosfato de açúcar estão do lado de fora da dupla hélice e as purinas e pirimidinas formam os “degraus” da escada de hélice de ADN. b) as duas cadeias de ADN são antiparalelares uma à outra. c) a direcção de cada cadeia é identificada pela numeração dos Carbões (1 a 5) em cada molécula de açúcar. O fim 5ʹ é aquele em que o carbono #5 não está ligado a outro nucleótido; o fim 3ʹ é aquele em que o carbono #3 não está ligado a outro nucleótido.

    emparelhamento de Base ocorre entre uma purina e pirimidina., No DNA, adenina (A) e timina (T) são pares de base complementares, e citosina (C) e guanina (G) também são pares de base complementares, explicando as regras de Chargaff (Figura 7). Os pares de base são estabilizados por ligações de hidrogênio; adenina e timina formam duas ligações de hidrogênio entre eles, enquanto citosina e guanina formam três ligações de hidrogênio entre eles.

    Figura 7. Ligações de hidrogênio formam-se entre bases azotadas complementares no interior do DNA.,

    no laboratório, expondo as duas cadeias de ADN da dupla hélice a altas temperaturas ou a determinados produtos químicos, pode quebrar as ligações de hidrogénio entre bases complementares, separando assim as cadeias em duas cadeias de ADN separadas (ADN de cadeia simples ). Este processo é chamado de desnaturação do DNA e é análogo à desnaturação proteica, como descrito em proteínas. As cadeias de ssDNA também podem ser colocadas juntas como DNA de cadeia dupla (dsDNA), através de reanálise ou renaturação por resfriamento ou remoção dos desnaturantes químicos, permitindo que essas ligações de hidrogênio se reformem., A capacidade de manipular artificialmente o ADN desta forma é a base para várias técnicas importantes da biotecnologia (Figura 8). Devido à ligação de hidrogênio adicional entre o par de base C = G, O DNA com um alto teor de GC é mais difícil de desnaturar do que o DNA com um menor teor de GC.

    Figura 8. No laboratório, a dupla hélice pode ser desnaturada com DNA de cadeia única através da exposição ao calor ou produtos químicos, e depois renaturada através do resfriamento ou remoção de desnaturantes químicos para permitir que as cadeias de DNA reanalisem., (credit: modification of work by Hernández-Lemus E, Nicasio-Collazo LA, Castañeda-Priego R)

    View an animation on DNA structure from the DNA Learning Center to learn more.

    pense sobre isso

    • Quais são os dois pares de base complementares de DNA e como eles estão ligados entre si?

    função do ADN

    ADN armazena a informação necessária para construir e controlar a célula. A transmissão desta informação das células mãe-filha é chamada de transferência genética vertical e ocorre através do processo de replicação do DNA., O DNA é replicado quando uma célula faz uma cópia duplicada de seu DNA, então a célula se divide, resultando na distribuição correta de uma cópia de DNA para cada célula resultante. O DNA também pode ser enzimaticamente degradado e usado como uma fonte de nucleósidos e nucleótidos para a célula. Ao contrário de outras macromoléculas, o DNA não serve um papel estrutural nas células.como é que o ADN transmite informação genética à descendência?,historicamente, as mulheres têm sido sub-representadas nas ciências e na medicina, e muitas vezes as suas contribuições pioneiras têm passado relativamente despercebidas. Por exemplo, apesar de Rosalind Franklin ter realizado os estudos de difração de raios-X demonstrando a estrutura helicoidal dupla do DNA, foi Watson e Crick que se tornaram famosos por esta descoberta, baseando-se em seus dados., Ainda há uma grande controvérsia sobre se a aquisição de seus dados foi apropriada e se conflitos de personalidade e preconceito de gênero contribuíram para o reconhecimento tardio de suas contribuições significativas. Da mesma forma, Barbara McClintock fez um trabalho pioneiro na genética do milho da década de 1930 até a década de 1950, descobrindo transposons (genes saltitantes), mas ela não foi reconhecida até muito mais tarde, recebendo um Prêmio Nobel de Fisiologia ou Medicina em 1983 (Figura 9).actualmente, as mulheres continuam sub-representadas em muitos domínios da ciência e da medicina., Enquanto mais de metade dos diplomas de graduação em ciências são concedidos a mulheres, apenas 46% dos diplomas de doutoramento em ciências são atribuídos a mulheres. Na academia, o número de mulheres em cada nível de progressão na carreira, continua a diminuir, com as mulheres ocupam menos de um terço dos cargos do Ph D. nível cientistas na posse-faixa de posições, e menos de um quarto do total cátedras nas 4 anos de faculdades e universidades., Mesmo nas profissões de saúde, como quase todas as outras áreas, as mulheres são muitas vezes sub-representadas em muitas carreiras médicas e ganham significativamente menos do que seus homólogos masculinos, como mostrado em um estudo de 2013 publicado pela Revista da Associação Médica Americana.por que essas disparidades continuam a existir e como quebramos esses ciclos? A situação é complexa e provavelmente resulta da combinação de vários fatores, incluindo como a sociedade condiciona os comportamentos das meninas de tenra idade e apoia seus interesses, tanto profissionalmente quanto pessoalmente., Alguns têm sugerido que as mulheres não pertencem ao laboratório, incluindo o vencedor do Prêmio Nobel Tim Hunt, cujos comentários públicos de 2015 sugerindo que as mulheres são muito emocionais para a ciência foram recebidos com condenação generalizada.talvez as raparigas devam ser mais apoiadas desde tenra idade nas áreas da ciência e da matemática (Figura 9). Os programas de Ciência, Tecnologia, Engenharia e matemática (STEM) patrocinados pela American Association of University Women (AAUW) e National Aeronautics and Space Administration (NASA) são excelentes exemplos de programas que oferecem tal apoio., As contribuições das mulheres na ciência devem ser divulgadas mais amplamente ao público, e o marketing dirigido às jovens raparigas deve incluir mais imagens de cientistas e profissionais de saúde de sucesso histórico e profissional, incentivando todas as jovens mentes brilhantes, incluindo raparigas e mulheres, a prosseguirem carreiras na ciência e na medicina.

    Figura 9. (a) o trabalho de Barbara McClintock sobre a genética do milho nos anos 1930 a 1950 resultou na descoberta de transposões, mas seu significado não foi reconhecido na época., b) os esforços de orientação adequada e de Apoio Social contínuo às mulheres no domínio da ciência e da medicina podem, um dia, contribuir para atenuar algumas das questões que impedem a igualdade entre homens e mulheres a todos os níveis na ciência e na medicina. (crédito a: modification of work by Smithsonian Institution; crédito B: modification of work by Haynie SL, Hinkle AS, Jones NL, Martin CA, Olsiewski PJ, Roberts mf)

Clinical Focus: Aamir, Part 2

este exemplo continua a história de Aamir que começou a usar a microbiologia para descobrir os segredos da vida.,com base em seus sintomas, o médico de Aamir suspeita que ele está sofrendo de uma doença causada por alimentos que ele adquiriu durante suas viagens. As possibilidades incluem infecção bacteriana (por exemplo, E. coli enterotoxigénica, Vibrio cholerae, Campylobacter jejuni, Salmonella), infecção viral (rotavírus ou norovírus), ou infecção por protozoários (Giardia lamblia, Cryptosporidium parvum, ou Entamoeba histolytica).

seu médico ordena uma amostra de fezes para identificar possíveis agentes causadores (por exemplo, bactérias, quistos) e para procurar a presença de sangue, porque certos tipos de agentes infecciosos (como C., jejuni, Salmonella e E. histolytica) estão associados à produção de fezes sangrentas.a amostra de fezes de Aamir não mostrou nem sangue nem quistos. Após a análise de sua amostra de fezes e com base em sua história recente de viagens, o médico do hospital suspeitou que Aamir estava sofrendo de diarréia do viajante causada por E. coli enterotoxigênica (ETEC), o agente causador da maior parte da diarréia do viajante., Para verificar o diagnóstico e descartar outras possibilidades, o médico de Aamir ordenou um teste de laboratório de diagnóstico de sua amostra de fezes para procurar sequências de DNA que codificam fatores específicos de virulência do ETEC. O médico instruiu Aamir a beber muitos líquidos para substituir o que ele estava perdendo e dispensou-o do hospital.o ETEC produz vários factores de virulência codificados por plasmídeos que o tornam patogénico em comparação com a E. coli típica. Estas incluem as toxinas secretadas enterotoxina labile térmica (LT) e enterotoxina estabile térmica (ST), bem como o factor de colonização (CF)., Tanto o LT como o ST causam a excreção de iões clorados das células intestinais para o lúmen intestinal, causando uma consequente perda de água das células intestinais, resultando em diarreia. CF codifica uma proteína bacteriana que ajuda a permitir que a bactéria adira ao revestimento do intestino delgado.porque é que o médico do Aamir usou análise genética em vez de isolamento de bactérias da amostra de fezes ou coloração Gram directa da amostra de fezes?

voltaremos ao exemplo de Aamir em páginas posteriores.,os ácidos nucleicos são compostos por nucleótidos, cada um dos quais contém um açúcar pentose, um grupo de fosfatos e uma base azotada. Os desoxirribonucleótidos no ADN contêm desoxirribose como açúcar pentose.

  • o ADN contém as pirimidinas citosina e timina, e as purinas adenina e guanina.os nucleótidos estão ligados entre si por ligações fosfodiésteres entre o grupo 5ʹ fosfato de um nucleótido e o grupo 3ʹ hidroxilo de outro., Uma cadeia de ácido nucleico tem um grupo fosfato livre na extremidade 5ʹ e um grupo hidroxila livre na extremidade 3ʹ.
  • Chargaff descobriu que a quantidade de adenina é aproximadamente igual à quantidade de timina no DNA, e que a quantidade de guanina é aproximadamente igual à de citosina. Estas relações foram mais tarde determinadas a ser devido a emparelhamento de base complementar.Watson and Crick, building on the work of Chargaff, Franklin and Gosling, and Wilkins, proposed the double helix model and base pairing for DNA structure.,o DNA é composto por duas cadeias complementares orientadas antiparalel umas às outras com as backbones fosfodiester no exterior da molécula. As bases azotadas de cada cadeia enfrentam-se mutuamente e bases complementares ligam-se hidrogénio um ao outro, estabilizando a dupla hélice.calor ou produtos químicos podem quebrar as ligações de hidrogénio entre bases complementares, desnaturando ADN. Resfriamento ou remoção de produtos químicos pode levar à renaturação ou recozimento de DNA, permitindo que as ligações de hidrogênio para a reforma entre bases complementares.,o DNA armazena as instruções necessárias para construir e controlar a célula. Esta informação é transmitida dos progenitores aos descendentes através de transferência vertical de genes.
  • escolha múltipla

    Qual das seguintes não se encontra no ADN?

    1. timina
    2. phosphodiester obrigações
    3. complementares da base de dados de emparelhamento
    4. aminoácidos
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    Resposta d. Aminoácidos não são encontradas no DNA.,se 30% das bases de uma molécula de ADN são adenina, Qual é a percentagem de timina?

    1. 20%
    2. 25%
    3. 30%
    4. 35%
    Mostrar Resposta

    Resposta c. 30% das bases será a timina.

    Qual das seguintes afirmações sobre emparelhamento de base no ADN está incorrecta?

    1. purinas sempre pares base com pirimidinas.a adenina liga-se à guanina.os pares de bases são estabilizados por ligações de hidrogénio.,o emparelhamento de Base ocorre no interior da dupla hélice.
    Mostrar Resposta

    Resposta b. Adenina se liga à guanina.

    Se uma cadeia de ADN contiver a sequência 5ʹ-ATTCGATCGA-3ʹ, qual das seguintes é a sequência da cadeia complementar de ADN?

    1. 5ʹ-TAAGGCCTAGCT-3ʹ
    2. 5ʹ-ATTCCGGATCGA-3ʹ
    3. 3ʹ-TAACCGGTACGT-5ʹ
    4. 5ʹ-TCGATCCGGAAT-3ʹ
    Mostrar Resposta

    Resposta d., 5ʹ-TCGATCGGAAT-3ʹ é a cadeia complementar de DNA.

    durante a desnaturação do ADN, qual das seguintes situações acontece?

    1. ligações de hidrogénio entre bases complementares quebram.as ligações Fosfodiésteres quebram – se na coluna vertebral do fosfato de açúcar.ligações de hidrogénio na espinha dorsal do fosfato de açúcar.ligações Fosfodiester entre bases complementares quebram.
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    Answer A. Hydrogen bonds between complementary bases break. ,

    preencha o espaço em branco

    o fim de uma cadeia de ácidos nucleicos com um grupo de fosfato livre é chamado de______.

    Show Answer

    The end of a nucleic acid strand with a free phosphate group is called the 5ʹ end.

    True/False

    o trabalho de Rosalind Franklin e R. G. Gosling foi importante na demonstração da natureza helicoidal do ADN.,

    Show Answer

    True

    The A-T base pair has more hydrogen bonding than the C-G base pair.

    Mostrar Resposta

    False

    Pensar sobre Isso

    1. Qual é o papel do phosphodiester obrigações dentro de açúcar-fosfato espinha dorsal do DNA?o que significa o termo antiparallel?”
    2. Porque é que o ADN com um elevado teor de GC é mais difícil de desnaturar do que aquele com um baixo teor de GC?,ao considerar a estrutura da dupla hélice de DNA, como você esperaria que a estrutura fosse diferente se houvesse emparelhamento de base entre duas purinas? Entre duas pirimidinas?uma determinada amostra de ADN é constituída por 22% de timina. Use as regras de Chargaff para preencher as porcentagens para as outras três bases azotadas.,
    base adenine guanine thymine cytosine
    % 22%

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