Uno dei problemi fondamentali nella ricerca di splicing di RNA è rappresentato dalla comprensione di come lo spliceosoma può definire con successo esoni e introni in una grande varietà di molecole di pre-mRNA con precisione nucleotidica. Fin dalla sua prima descrizione, i ricercatori in questo campo hanno identificato e caratterizzato molti elementi fondamentali e attori in grado di influenzare il processo di splicing, sia in modo negativo che positivo., In effetti, si può sostenere che oggi sappiamo molto sulle forze che fanno un esone, un esone e un introne, un introne. Come verrà discusso in questa revisione, queste decisioni sono il risultato di un complesso controllo combinatorio derivante da molti fattori/influenze diversi., Soprattutto, queste influenze agiscono su diversi livelli di complessità a partire dall’interazione relativamente semplice tra due siti di giunzione 5′ e 3′ di consenso a fattori molto più complessi: come l’interazione tra sequenze di silenziatore o enhancer, processività trascrizionale, ambiente genomico, posizionamento dei nucleosomi e modifiche degli istoni a livello di cromatina. A seconda dei contesti locali, tutti questi fattori agiranno antagonisticamente o sinergicamente per decidere il destino di esone/introne di una data sequenza di RNA., Al momento, tuttavia, ciò che ci manca ancora è una comprensione precisa di come tutti questi processi si sommano per aiutare lo spliceosome a raggiungere una decisione. Pertanto, si prevede che le sfide future nella ricerca di splicing saranno l’attenta caratterizzazione di tutte queste influenze per migliorare la nostra capacità di prevedere le scelte di splicing in diversi organismi o in contesti specifici.
