Una dintre problemele fundamentale în ARN despicare de cercetare este reprezentat de înțelegerea modului în care spliceosome cu succes poate defini exoni și introni într-o mare varietate de pre-arnm molecule cu nucleotide precizie. Încă de la prima descriere, cercetătorii din acest domeniu au identificat și caracterizat multe elemente fundamentale și jucători capabili să afecteze procesul de îmbinare, atât într-o manieră negativă, cât și pozitivă., Într-adevăr, se poate argumenta că astăzi știm foarte multe despre forțele care fac un exon, un exon și un intron, un intron. După cum se va discuta în această revizuire, aceste decizii sunt rezultatul unui control combinatorial complex care rezultă din mai mulți factori/influențe diferite., Cel mai important, aceste influențe acționează pe mai multe niveluri de complexitate, pornind de la cele relativ simple de interacțiune între două consens 5′ și 3′ splice site-uri mult mai complexe de factori, cum ar fi: interacțiunea între amortizorul de zgomot sau potențiator de secvențe, transcripțional processivity, genomice milieu, nucleosome de poziționare, și histone modificări la nivelul cromatinei. În funcție de contextele locale, toți acești factori vor acționa antagonist sau sinergic pentru a decide soarta exonului/intronului oricărei secvențe ARN Date., În prezent, însă, ceea ce ne lipsește încă este o înțelegere precisă a modului în care toate aceste procese se adaugă pentru a ajuta spliceosomul să ia o decizie. Prin urmare, este de așteptat ca provocările viitoare în cercetarea de îmbinare să fie caracterizarea atentă a tuturor acestor influențe pentru a îmbunătăți capacitatea noastră de a prezice alegerile de îmbinare în diferite organisme sau în contexte specifice.