en 1924, fue nombrado director de la Oficina de investigación, que pasó a llamarse FBI en 1935, y Hoover redujo gran parte de la ineficiencia y la corrupción que existía dentro de la agencia. Lo logró despidiendo a una serie de agentes a quienes consideraba nombrados políticamente o no calificados para el cargo. Para los nuevos agentes, trajo verificaciones de antecedentes, entrevistas y entrenamiento físico. Hoover también revivió la antigua tradición de la Oficina de dar a los agentes de contabilidad y formación legal.,
estableció archivos centralizados de huellas dactilares y estadísticas, comenzó un laboratorio de Criminalística e introdujo una academia de capacitación. A principios de la década de 1930, Hoover comenzó una guerra contra los «enemigos públicos» para capturar a líderes del crimen organizado, como «Pretty Boy» Floyd y «Baby Face» Nelson.
aunque no tuvo éxito en debilitar el crimen organizado, su campaña elevó el perfil del FBI. Durante la Segunda Guerra Mundial, Hoover estuvo a cargo de proteger a los Estados Unidos de los agentes enemigos. Durante las décadas de 1940 y 1950, la Oficina obtuvo titulares por sus firmes esfuerzos contra el espionaje Nazi y comunista.,
a medida que se desarrollaba la Guerra Fría, Hoover persiguió a las organizaciones e individuos, que creía que eran comunistas, con el vigor que había exhibido en las redadas de Palmer. El presidente Roosevelt de los Estados Unidos encargó al Buró que dirigiera un servicio de Inteligencia Extranjera en el hemisferio occidental durante la Guerra Fría. Fue apodado el servicio especial de inteligencia o SIS.
It also took on the task of investigating the background of government staff to ensure foreign agents did not infiltrate it. En ese momento, los delitos más tradicionales, como los robos de automóviles, los robos de bancos y los secuestros, seguían siendo importantes.,en las décadas de 1960 y 1970, la Oficina de Hoover llevó a cabo investigaciones en el campo de los derechos civiles y el crimen organizado, así como la amenaza de violencia política. En ese momento, Hoover tenía más de 65 años, pero el presidente quería mantenerlo al timón.
Hoover fue una figura controvertida. Sirvió bajo ocho presidentes y aseguró un tremendo grado de poder personal. Su búsqueda obsesiva de organizaciones de izquierda, y otras supuestamente «peligrosas», hizo que muchos lo acusaran de violar los derechos civiles y perseguir vendettas personales.
Cuando J., Edgar Hoover murió mientras dormía el 2 de mayo de 1972 a la edad de 77 años, había dirigido el FBI durante 48 años.
hubo rumores durante su vida y después de su muerte de que Hoover era homosexual ya que nunca se casó. Se pensaba que Clyde Tolson, el director asociado del FBI y heredero de Hoover, era su amante.
comieron juntos, trabajaron juntos, fueron a clubes nocturnos juntos y vacacionaron juntos. Tolson heredó la propiedad de Hoover después de su muerte y está enterrado cerca de él en el Cementerio del Congreso.,
Sin embargo, Hoover cazó y amenazó a cualquiera que insinuara cosas sobre su sexualidad. También estuvo vinculado románticamente con la actriz Dorothy Lamour en las décadas de 1930 y 1940. durante las décadas de 1940 y 1950, Hoover estuvo a menudo acompañado por Lela Rogers y muchos de sus amigos comunes pensaron que se casarían.
en 2011, Clint Eastwood dirigió ‘J Edgar’ protagonizada por Leonardo Di Caprio en el papel principal, por el que fue nominado para un Oscar. La película describe su carrera y su vida a puerta cerrada.