durante la Revolución francesa en 1789 los colores rojo, blanco y azul fueron adoptados, primero como una «escarapela», un nudo de cintas que se llevaba en el pelo; los colores eran los de la ciudad de París con el color real blanco y esto se convirtió en la actual bandera» tricolor » que se hizo oficial en 1794. En 1798 el líder Haitiano negro Toussaint L’ouverture también adoptó el tricolor francés como su bandera cuando era nominalmente gobernador de la colonia., Después de que Toussaint L’ouverture escribiera una constitución separatista, los franceses lo invadieron, lo secuestraron y lo llevaron a Francia. En julio de 1802 el pueblo negro, dirigido por Jean-Jacques Dessalines, se rebeló contra los franceses y en febrero de 1803, en Petite Rivière de l’Artibonite, Jean-Jacques Dessalines, jefe de los rebeldes negros, y Alexandre Pétion, líder de los mulatos, proclamaron la independencia de Haití., El 18 de mayo de 1803, en el Congreso de Arcahaie, todos los jefes declararon su lealtad a Dessalines, quien rompió la bandera francesa, tiró la franja blanca como símbolo de los blancos y cosió las rayas restantes por Catherine Flon, la ahijada de Jean-Jacques Dessalines como la primera bandera Haitiana. Se añadió la inscripción «Liberté ou La Mort» (libertad o muerte) y se utilizó como bandera militar. El 1 de enero de 1804, día de la Independencia, la bandera fue modificada: esta vez las bandas azules y rojas se colocaron horizontalmente: esta fue la primera bandera de la república independiente de Haití.,
El 8 de octubre de 1804 Dessalines fue proclamado emperador de Haití bajo el nombre de Jacques I y la banda azul (colocada verticalmente de nuevo) fue cambiada a Negro el 20 de mayo de 1805; esto puede interpretarse como un símbolo de la gente del país o los colores podrían simbolizar el lema «Libertad (rojo) o muerte (Negro)». Después de que Dessalines, que gobernaba como déspota, fuera asesinado, el país se dividió: la república en el norte, dirigida por Henri Christophe (1806 – 1820) retuvo esta bandera. El General Pétion fue proclamado presidente del Sur y oeste de Haití el 19 de marzo de 1807., Pétion cambió su bandera vertical azul-roja a la configuración horizontal de 1804. Añadió un rectángulo blanco con los brazos del país: una palmera coronada por el gorro frigio de la libertad, banderas y cañones y el lema «L’Union FAIT la FORCE» (a través de la unidad encontramos la fuerza). Esta bandera ha perdurado a lo largo de los siglos XIX y XX, con cambios menores en los brazos y el tamaño del rectángulo blanco.
Henri Christophe, que fue reconocido en el norte, noroeste y en Arbonite había mantenido la bandera imperial negra y roja de Dessalines., Construyó la Citadelle Laferrière o Citadelle Henri Christophe, una gran fortaleza en la cima de una montaña, construida entre 1805 y 1820 como parte de un sistema de fortificaciones diseñado para mantener a la recién independizada nación de Haití a salvo de las incursiones francesas. El 28 de marzo de 1811 fue proclamado rey bajo el nombre de Enrique I, y la bandera fue cambiada: roja en el Ho y negra en la mosca con, en el centro, un escudo con un fénix bajo cinco estrellas de cinco puntas, todo en oro sobre un fondo azul; El escudo llevaba una corona y la inscripción latina «Ex cinerebus nascitur» (de las cenizas nos levantaremos)., Esto duró hasta 1818, cuando Pétion conquistó el norte, depuso a Enrique e impuso la bandera azul y roja. En 1847 Faustin Soulouque fue elegido presidente de Haití, pero luego se proclamó emperador en una lujosa ceremonia inspirada por Napoleón, bajo el nombre de Faustin I (1849-1859). En 1849 el escudo de armas fue reemplazado por símbolos imperiales. El Imperio de Faustin I terminó el 15 de enero de 1859 cuando fue derrocado y enviado al exilio y el escudo de armas de la República fue reintroducido.,
Haití ha tenido una historia muy caótica desde entonces, con golpes de estado, intervención extranjera y ocupación estadounidense de 1915 a 1934. Luego, en 1957, el Dr. François Duvalier («Papa Doc») se convirtió en Presidente de Haití. En 1964 se hizo presidente vitalicio y el 25 de mayo de 1964 se restauró la bandera negra y roja de Dessalines; fue oficialmente readoptada el 21 de junio de 1964 como bandera Civil de Haití (en proporciones 1:2). La bandera estatal o nacional presentaba el escudo de armas, con las banderas también cambiadas a las divididas verticalmente negras y rojas y sin gorra de la libertad Frigia sobre la palmera., Después de la muerte de Papa Doc en 1971 fue sucedido por su hijo Jean-Claude Duvalier («Baby Doc»). Un levantamiento popular en 1986 llevó a su derrocamiento. El 25 de febrero de 1986 el pueblo pidió que se restableciera la bandera roja y azul. La Constitución de 1987 confirmó la bandera Civil como azul sobre rojo. Las proporciones eran ahora 3:5, aunque a veces se usaban banderas con otras proporciones (como 3:4). El escudo de armas original fue reintroducido, pero de menor tamaño: el ancho del rectángulo es una quinta parte del ancho de la bandera., Sin embargo, se pueden ver banderas con rectángulos mucho más grandes, por lo que esto no parece ser una regla dura y rápida.